臺灣與日本長期以來在經濟貿易、文化交流等各領域保持著緊密互動。我國的對日窗口「亞東關係協會」（後改名為「臺灣日本關係協會」）為加強臺日科技交流與合作，於2003年成立「科技交流委員會」，首任主任委員由後來擔任副總統的蕭萬長先生出任。在他的倡議下，眾多有識之士著手籌備以促進臺日科技交流為宗旨的民間組織，最終於2008年3月14日正式成立本會。

本會的首任理事長由行政院前政務委員蔡清彥博士擔任，後續歷任理事長包括國家發展委員會前主任委員陳添枝博士、常在國際法律事務所資深顧問莊月清博士，以及前經濟部常務次長黃重球博士等，他們皆對本會的發展貢獻卓著。在2024年4月舉行的第九屆會員大會中，新北市前副市長吳明機博士當選為現任理事長，並帶領本會積極推動臺日產業技術合作，開創新局。

隨著國際政經情勢的變遷，臺日雙方的關注度顯著提升。吳理事長指出，臺日產業科技的互補性極高，臺灣在生產製造、成本控制、運籌管理、高素質人力資源及完整供應鏈等方面具備優勢；而日本則在半導體、光電、機械、電子等產業的關鍵性材料、零組件及專利研發成果上表現出色。近年來，東亞經濟快速整合，本會以深化臺日優勢結合為目標，強化企業合作，積極拓展新興市場，開創全球商機，為雙方未來共榮奠定基石。

— TJCITのご紹介—

長い間、台湾と日本は経済貿易や観光文化など様々な領域で活発な交流を続けています。2003年、我が国の対日窓口である亜東関係協会（後に台湾日本関係協会に改称）は、双方の科学技術交流と提携を強化するために、科学技術交流委員会を設立しました。後ほど副総統である蕭萬長氏が初代主任委員を務めました。彼の呼びかけにより、有識者たちが双方の科学技術交流を促進することを目的とした民間組織の設立に向けて準備を始めました。こうして、2008年3月14日に、本会は正式に設立されました。

元行政院政務委員蔡清彦氏が本会初代の理事長を務めました。それから、元国家発展委員会主任委員陳添枝氏とツァア＆ツァイ国際法律事務所シニアアドバイザー莊月清氏、元経済部常務次長黃重球氏の歴代理事長は引き継ぎ、本会の発展に貢献しました。2024年4月の第九回会員大会において、元新北市副市長の呉明機氏が新任理事長として選ばれ、台日間の産業技術提携に関わる全面的なサービスの提供及び提携を積極的に取り組んでいます。